Mgr de Coislin avait installé, en 1687, un petit séminaire diocésain à Meung-sur-Loire. Celui-ci subsista jusqu'en 1793.
En 1804, grâce aux largesses de l'abbé Mérault, son fondateur et premier supérieur, le petit séminaire d'Orléans est établi au chevet de la cathédrale, (rue Robert-de-Courtenay).
Dès 1805 et jusqu'en 1829, il accueille dans ses locaux, le grand séminaire, grâce à l'acquisition de maisons voisines dans la rue Saint-Etienne.
En 1846, Mgr Fayet transfère son petit séminaire à La Chapelle-Saint-Mesmin où il se maintient jusqu'en 1906.
Le petit séminaire de Sainte-Croix fut fondé par Mgr Dupanloup, en 1851 dans les anciens communs de l'évêché (entrée rue du Bourdon-Blanc).
En 1860 il est installé rue d'Illiers, dans l'ancien couvent des Minimes.